65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0787 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  86.44 
 
 		 179 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  86.44 
 
 		 179 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  86.44 
 
 		 179 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  85.31 
 
 		 179 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  76.84 
 
 		 180 aa  277  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  76.84 
 
 		 180 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  75.71 
 
 		 180 aa  274  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  79.1 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  57.14 
 
 		 176 aa  207  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  62.5 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  61.18 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  35.5 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  32.95 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  33.02 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 493 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 		 513 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.21 
 
 		 549 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  26.05 
 
 		 514 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  36.14 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  30.69 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.18 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.88 
 
 		 512 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  30.11 
 
 		 522 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  28.3 
 
 		 555 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.77 
 
 		 504 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  29.9 
 
 		 492 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.47 
 
 		 480 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.59 
 
 		 530 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  37.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 443 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.97 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  40.43 
 
 		 547 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  27.88 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.99 
 
 		 551 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  29.91 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  27.88 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  32.08 
 
 		 575 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  27.88 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  27.14 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  35.44 
 
 		 501 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  30.39 
 
 		 161 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  26.44 
 
 		 539 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  39.53 
 
 		 498 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 		 166 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.81 
 
 		 203 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 506 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  32.56 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  36.51 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  32.84 
 
 		 550 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 658 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  29.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>