71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2125 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  87.15 
 
 		 179 aa  324  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  44.71 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  43.4 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  38.89 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  41.98 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  40.36 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  42.95 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  42.51 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  41.03 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  35.93 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  37.13 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 282 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  38.12 
 
 		 283 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  37.8 
 
 		 291 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  40.76 
 
 		 247 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  38.32 
 
 		 243 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  35.93 
 
 		 371 aa  104  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  33.52 
 
 		 252 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  27.11 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  29.59 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.55 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.99 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.99 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  27.06 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  24.44 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  33.73 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  31.25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  24.4 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.76 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  27.74 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25.98 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  23.94 
 
 		 574 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  24.28 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  23.95 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  38.24 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  23.13 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  36.76 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.47 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  29 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.75 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  39.34 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  25.2 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.91 
 
 		 449 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  32.05 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  37.7 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  37.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  37.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25.35 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.36 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  37.04 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  36.07 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  23.85 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  36.07 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  23.97 
 
 		 180 aa  42  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  27.5 
 
 		 178 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.03 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  27.34 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.97 
 
 		 512 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  23.78 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>