74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0600 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24.22 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  30.51 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  28.16 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  26.59 
 
 
179 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  30 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25.86 
 
 
175 aa  62  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25.86 
 
 
180 aa  62  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.64 
 
 
219 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.61 
 
 
167 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  25.13 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  33.58 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  33.08 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  33.85 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.86 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  26.88 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  26.51 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  29.68 
 
 
186 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.17 
 
 
174 aa  55.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 
174 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 
479 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  26.74 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  30.57 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  30.57 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  30.08 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  26.19 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  26.98 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29.85 
 
 
283 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  30.13 
 
 
158 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.6 
 
 
291 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 
172 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  26.49 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  25.27 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  33.68 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  25.27 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  35.06 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  29.87 
 
 
155 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  26.21 
 
 
155 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  28.04 
 
 
166 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  23.33 
 
 
146 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  34.21 
 
 
575 aa  48.5  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  31.21 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  22.09 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  27.67 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  22.09 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.13 
 
 
170 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  27.52 
 
 
542 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  29.69 
 
 
547 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  24.85 
 
 
169 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  30.6 
 
 
180 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  29.85 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  27.38 
 
 
176 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  22.09 
 
 
180 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.87 
 
 
646 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  24.48 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  35.44 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  32.03 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  30.21 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  30.43 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  20 
 
 
371 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  28.4 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  25.68 
 
 
177 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  27.41 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2589  hypothetical protein  26.52 
 
 
332 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0851  hypothetical protein  23.45 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.07 
 
 
579 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0867  hypothetical protein  23.45 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.90391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  31.46 
 
 
486 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  27.16 
 
 
169 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>