74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4935 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  73.3 
 
 		 176 aa  260  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  74.12 
 
 		 170 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  68.86 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  63.07 
 
 		 176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  46.99 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  43.64 
 
 		 282 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  41.92 
 
 		 247 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  40.36 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  40.36 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  39.88 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  42.95 
 
 		 371 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  41.36 
 
 		 255 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  39.76 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  40.91 
 
 		 291 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  42.01 
 
 		 283 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  37.95 
 
 		 243 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  36.31 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  32.69 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  34.26 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  33.09 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  33.09 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  33.09 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  31.41 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  31.06 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  32.61 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  30.08 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  29.68 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  30.19 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  29.41 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  29.29 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  20 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  27.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  27.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  30.43 
 
 		 574 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  28.81 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  35.59 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  27.59 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  25.3 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  23.87 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.2 
 
 		 504 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  31.17 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 		 179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 		 179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 483 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  31.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 575 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.4 
 
 		 514 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 		 522 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  29.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  22.83 
 
 		 209 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  25.84 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>