54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0579 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  45.7 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  45.03 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  39.74 
 
 
165 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  42.04 
 
 
158 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  40.37 
 
 
178 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  36.91 
 
 
146 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  37.09 
 
 
172 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  38.41 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32.05 
 
 
180 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32.05 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  89  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  36 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  32.72 
 
 
227 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  31.36 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  32.03 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 
181 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  34.67 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  28.66 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  28.66 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  28.66 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  25.95 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.25 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  28.48 
 
 
229 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  28.48 
 
 
289 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30 
 
 
232 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.28 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  23.18 
 
 
203 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.61 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.96 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  29.23 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  25.83 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  33.85 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.83 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  29.58 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  30.26 
 
 
252 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  27.07 
 
 
186 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  26.81 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  33.96 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  25.36 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2018  hypothetical protein  31.75 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.34 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  24.65 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1556  hypothetical protein  34.85 
 
 
199 aa  40.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.631948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  28.24 
 
 
255 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>