60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0819 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  70.81 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  43.27 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  42.94 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  41.83 
 
 		 245 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  38.76 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  41.98 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  39.74 
 
 		 282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  42.04 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  38.89 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  36.75 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  37.09 
 
 		 371 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  39.58 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  39.19 
 
 		 283 aa  104  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  36.24 
 
 		 255 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.4 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  30.72 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  29.25 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  27.01 
 
 		 574 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  28.79 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.5 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.72 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  29.68 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  26.17 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  25.79 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  31.03 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  32.69 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  28.74 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0863  hypothetical protein  25.79 
 
 		 554 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  31.71 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  26.06 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  26.75 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  28.48 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  25.36 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  28.12 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.16 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.74 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0323  hypothetical protein  22 
 
 		 495 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.12 
 
 		 575 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  29.17 
 
 		 541 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  24.82 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.63 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.27 
 
 		 513 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  27.07 
 
 		 153 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  24.34 
 
 		 146 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  25.47 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>