67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0717 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  57.26 
 
 
291 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  57.14 
 
 
283 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  43.45 
 
 
176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  40.12 
 
 
174 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  35.93 
 
 
179 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  38.41 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  36.54 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  43.14 
 
 
176 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  40.25 
 
 
170 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  37.27 
 
 
247 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  36.25 
 
 
169 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  32.76 
 
 
371 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  37.01 
 
 
243 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  33.53 
 
 
172 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  34.34 
 
 
245 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  36.24 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  31.14 
 
 
170 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  35.95 
 
 
186 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  32.3 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  37.18 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  32.35 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  27.87 
 
 
181 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  27.05 
 
 
172 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  26.32 
 
 
172 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  32.97 
 
 
181 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 
232 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  25.83 
 
 
574 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  23.13 
 
 
166 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.86 
 
 
479 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  26.12 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.82 
 
 
182 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  32.32 
 
 
176 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.67 
 
 
575 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  27.07 
 
 
541 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.39 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  26.74 
 
 
179 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  32.2 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  32.91 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  24.42 
 
 
173 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  26.19 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  29.7 
 
 
155 aa  45.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  27.16 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  25.18 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 
166 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  20.51 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  23.53 
 
 
163 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  24.27 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 
179 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
179 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  23.17 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 
179 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 
179 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  30.49 
 
 
157 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>