55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0734 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  583  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  91.61 
 
 		 283 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  57.26 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  39.52 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  38.46 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  39.49 
 
 		 179 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  40.83 
 
 		 174 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  38.61 
 
 		 179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  41.76 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  43.21 
 
 		 176 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  37.27 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  35.9 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  41.38 
 
 		 169 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  45.63 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  39.58 
 
 		 186 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  38.21 
 
 		 172 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  32.12 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  37.59 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  33.54 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  33.11 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  26.97 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  26.97 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.97 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  25.2 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  28.28 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  28.85 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.93 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.28 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  31.86 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  30.89 
 
 		 203 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  30.41 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  29.58 
 
 		 181 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30.6 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  25.74 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  33.73 
 
 		 189 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  28.92 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  25.47 
 
 		 166 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3144  hypothetical protein  27.74 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  26.42 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  31.43 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  44 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  30.65 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  30.92 
 
 		 574 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 179 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  30.83 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.69 
 
 		 549 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>