44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2094 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  357  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  42.77 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  35.37 
 
 
146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  36.81 
 
 
172 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  34.97 
 
 
165 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  32.14 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  36.26 
 
 
175 aa  94.4  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  36.26 
 
 
180 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  36.59 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  34.81 
 
 
155 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  35.22 
 
 
167 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  36.08 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  28.1 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  28.1 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  29.94 
 
 
479 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.14 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  29.94 
 
 
126 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 
227 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.67 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.54 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  31.62 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.33 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  25.53 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  25.83 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  30.66 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  27.15 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  25.76 
 
 
252 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  35.37 
 
 
176 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  23.68 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  26.39 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.34 
 
 
283 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.61 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  32.97 
 
 
291 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  27.22 
 
 
289 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  25.9 
 
 
371 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  24.83 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  36 
 
 
255 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>