58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1300 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  74.89 
 
 		 229 aa  314  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  48.87 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  37.44 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  27.18 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.36 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  25.5 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  34.94 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  28.17 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  34.83 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  27.66 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.89 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  32.5 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  23.46 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  37.84 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  28.18 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  29 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  32.29 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  26.53 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  32.56 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  29.67 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  27.2 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  29.79 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.28 
 
 		 153 aa  48.5  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  23.58 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  31.46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  24.72 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.55 
 
 		 479 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  23.2 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  29 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  28 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25.22 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  35.53 
 
 		 558 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  27.42 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  27.03 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 504 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  34.06 
 
 		 519 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  28.12 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  26.19 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 182 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  32.61 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  22.31 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  25.21 
 
 		 169 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>