59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0702 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  340  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  53.85 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  40.36 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  41.86 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  38.73 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  37.58 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  37.11 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  36.42 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.91 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.52 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  35.97 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  32 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.93 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  32.91 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  31.01 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  35.25 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  29.94 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  44.05 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  27.61 
 
 		 479 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.74 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.17 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.17 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  28.03 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.38 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  26.45 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  25.79 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  29.93 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  27.45 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  28.86 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.49 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  23.88 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  29.55 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  27.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  27.21 
 
 		 282 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  27.59 
 
 		 225 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  25.3 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  27.83 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  24.05 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  33.01 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.73 
 
 		 512 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  32.05 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  32.05 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  32.05 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.88 
 
 		 172 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  26.61 
 
 		 126 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.21 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  27.84 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  36.84 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.97 
 
 		 486 aa  40.8  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>