93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2098 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 558 aa  1109    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  41.57 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  40.58 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  39.78 
 
 		 555 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  36.6 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  51.84 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  36.12 
 
 		 491 aa  237  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  45.49 
 
 		 521 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  32.27 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.96 
 
 		 476 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  30.79 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  30.6 
 
 		 766 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  29.97 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.03 
 
 		 632 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  27.95 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  30.29 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.32 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.05 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  28.09 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  25.53 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.22 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  27.5 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.19 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  34.95 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  31.68 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  27.09 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  38.3 
 
 		 165 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.11 
 
 		 167 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  36.73 
 
 		 161 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.17 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.08 
 
 		 513 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.2 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.67 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  26.85 
 
 		 673 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 646 aa  54.3  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  35.8 
 
 		 183 aa  54.3  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  21.05 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.48 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  41.18 
 
 		 165 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  39.77 
 
 		 174 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  34.69 
 
 		 174 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  21.63 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.59 
 
 		 471 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  34.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  22.18 
 
 		 611 aa  51.2  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 182 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  32.95 
 
 		 170 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 		 171 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  23.51 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  26.72 
 
 		 195 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 		 171 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 182 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.02 
 
 		 522 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.77 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 		 161 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  30.97 
 
 		 165 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  33.87 
 
 		 193 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  25.61 
 
 		 476 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  18.94 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.25 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  27.96 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.76 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  26.89 
 
 		 228 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  26.47 
 
 		 173 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  35.8 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  33 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 		 181 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  28.81 
 
 		 199 aa  44.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  32.99 
 
 		 170 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  28.38 
 
 		 158 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.45 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  27.03 
 
 		 158 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  31.75 
 
 		 158 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  23.66 
 
 		 544 aa  43.9  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.55 
 
 		 146 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.55 
 
 		 146 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>