91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  100 
 
 		 504 aa  969    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  47.09 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  44.2 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  42.75 
 
 		 516 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  39.31 
 
 		 634 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  46.68 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  38.95 
 
 		 609 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  35.88 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  37.24 
 
 		 540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  37.62 
 
 		 491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  50.38 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  34.31 
 
 		 507 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  34.93 
 
 		 554 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  36.76 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  35.81 
 
 		 511 aa  170  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  33.72 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  34.47 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  33.93 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  30.45 
 
 		 643 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  32.99 
 
 		 483 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  34.04 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  33.26 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  31.63 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  34.78 
 
 		 611 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  28.86 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.16 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.86 
 
 		 486 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.33 
 
 		 480 aa  87  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.79 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.07 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.75 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.15 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.31 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.62 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.12 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.56 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  26.64 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  27.85 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  20.89 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.34 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.51 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.67 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.09 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.09 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  20.09 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.69 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  29.57 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.54 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  28.88 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.84 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  24.09 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.85 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.52 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.48 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.19 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.45 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  40.38 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  26.18 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  29.43 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.88 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.19 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  36.73 
 
 		 558 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  32.95 
 
 		 619 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  38.38 
 
 		 587 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.69 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  22.41 
 
 		 542 aa  50.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  25.73 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  21.19 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 579 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.15 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  22.46 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  28.79 
 
 		 766 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.68 
 
 		 673 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  22.62 
 
 		 515 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  36.49 
 
 		 163 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.68 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  23.76 
 
 		 575 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.57 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  30.09 
 
 		 700 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  31.78 
 
 		 164 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25.15 
 
 		 228 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>