78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2821 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
527 aa  1028    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  43.93 
 
 
504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  42.55 
 
 
516 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  44.44 
 
 
550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  41.1 
 
 
519 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  37.7 
 
 
609 aa  270  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  38.09 
 
 
634 aa  266  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  36.05 
 
 
554 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  38.11 
 
 
501 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  35.63 
 
 
507 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  35.51 
 
 
491 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  46.38 
 
 
658 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  32.08 
 
 
540 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  34.44 
 
 
483 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 
511 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  33.27 
 
 
487 aa  177  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  32.73 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  33.04 
 
 
554 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 
486 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  33.03 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  33.95 
 
 
480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  32.81 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  29.22 
 
 
611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.57 
 
 
508 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  32.38 
 
 
532 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.1 
 
 
643 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  27.99 
 
 
632 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.32 
 
 
493 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  26.45 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  23.74 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  25.71 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.58 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.92 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  22.24 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.07 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.52 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.65 
 
 
472 aa  67  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.65 
 
 
472 aa  67  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  22.41 
 
 
541 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.65 
 
 
472 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.09 
 
 
472 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.98 
 
 
476 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  22.3 
 
 
542 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  22.27 
 
 
480 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  31.85 
 
 
673 aa  61.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.06 
 
 
549 aa  60.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.12 
 
 
512 aa  60.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.7 
 
 
471 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.98 
 
 
494 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.44 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  23.08 
 
 
501 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.04 
 
 
474 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  25.09 
 
 
646 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.81 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.63 
 
 
619 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.88 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  19.82 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.69 
 
 
479 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.35 
 
 
575 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.76 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.15 
 
 
579 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  23.74 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 
171 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.43 
 
 
489 aa  50.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.91 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.25 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  27.41 
 
 
177 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  24.56 
 
 
766 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  19.62 
 
 
527 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  19.62 
 
 
527 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  24.55 
 
 
449 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.37 
 
 
492 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  26.62 
 
 
195 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  29.76 
 
 
164 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  29.89 
 
 
700 aa  43.5  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.85 
 
 
192 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  26.19 
 
 
170 aa  43.5  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>