79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1331 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 511 aa  964    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  42.65 
 
 		 507 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  35.48 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  35.2 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  35.86 
 
 		 491 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  35.69 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 611 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  32.61 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  34.91 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  35.01 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  34.7 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  35.12 
 
 		 474 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  32.98 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  29.6 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  36.02 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  32.68 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  33.12 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 550 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  32.96 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.3 
 
 		 643 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  29.82 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  31.83 
 
 		 532 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.27 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  35.96 
 
 		 658 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.05 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.01 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.84 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.22 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.09 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.26 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.95 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.09 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.62 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  19.49 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  22.59 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.02 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  17.93 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.18 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  24.53 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.87 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.18 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  17.93 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  17.61 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  25.09 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.58 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.57 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  29.76 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  17.81 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  17.81 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.04 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  17.09 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  20.58 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  19.92 
 
 		 541 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.63 
 
 		 513 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30 
 
 		 673 aa  54.3  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.79 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.54 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  21.05 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.6 
 
 		 494 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.54 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.51 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  23.76 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  27.13 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  18.92 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  18.92 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.27 
 
 		 521 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  20.49 
 
 		 504 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  28.08 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1762  hypothetical protein  28.42 
 
 		 155 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00888497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1491  membrane flanked domain-containing protein  28.42 
 
 		 155 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.73 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.09 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  24.27 
 
 		 174 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  35.16 
 
 		 168 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.46 
 
 		 551 aa  43.5  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>