72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01635 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1108    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  28.79 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.63 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.49 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 		 541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.93 
 
 		 514 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  25.82 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  22.54 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  25.44 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  24.77 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  22.57 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  21.83 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  23.84 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  21.57 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  22.02 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.38 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  22.2 
 
 		 527 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.58 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  38.55 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  21.37 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.04 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.48 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  20.44 
 
 		 634 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.89 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  32.97 
 
 		 579 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  21.35 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  22.09 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.27 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  20.91 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.69 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  19.05 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  19.9 
 
 		 646 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.69 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.44 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  20.99 
 
 		 609 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.73 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  29.55 
 
 		 539 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  22.19 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  31.03 
 
 		 575 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  26.9 
 
 		 530 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  22.01 
 
 		 491 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  26.88 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  29.89 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  31.86 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  25.64 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  27.1 
 
 		 508 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  23.73 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.07 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  22.4 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.14 
 
 		 486 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  18.88 
 
 		 542 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.22 
 
 		 474 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  18.93 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  30.95 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  21.12 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.82 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.59 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  18.55 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  25.68 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  25.89 
 
 		 152 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 486 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.8 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  28.95 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 474 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 486 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>