101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3048 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  346  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  32.54 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  45.98 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  41.67 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  44.23 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  37.89 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  40.2 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  36.7 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  40.26 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  37.93 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  36.54 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  33.03 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  35.24 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.47 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.8 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  42.17 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  42.7 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.47 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  36.63 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  32.41 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.91 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 575 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.87 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  32.97 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  32.97 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  31.87 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 		 555 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  32.99 
 
 		 700 aa  52.4  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  29.35 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  31.87 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 549 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  25.93 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  37.35 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  27.72 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.16 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  41.82 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  37.93 
 
 		 555 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  29 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  33.96 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  34.92 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  34.69 
 
 		 530 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  33.61 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  31.03 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  22.89 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  38.57 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  33.33 
 
 		 491 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  32.89 
 
 		 489 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  30.67 
 
 		 632 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  32.99 
 
 		 558 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  31.58 
 
 		 476 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.61 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  28.95 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  32.88 
 
 		 619 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  31.17 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  28.05 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25 
 
 		 673 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.34 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  34.21 
 
 		 539 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  31.03 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28 
 
 		 547 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  26.44 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  27.69 
 
 		 494 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30.83 
 
 		 575 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>