159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3577 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  100 
 
 		 512 aa  996    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  56 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  27.29 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.9 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  28.05 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.94 
 
 		 549 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  28.23 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.85 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.84 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.66 
 
 		 632 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.52 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  22.94 
 
 		 495 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  23.09 
 
 		 513 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  22.45 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  26.76 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.79 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  23.3 
 
 		 542 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.23 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.15 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.86 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.35 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.2 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.35 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.38 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.34 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.21 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  26.37 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.44 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  24.64 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.62 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  19.62 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  19.27 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  18.32 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.36 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.14 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  19.28 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  19.28 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  28.18 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  33.56 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.59 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  26.62 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  18.34 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  18.87 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  18.87 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  19.07 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  26.11 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  23.59 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  26.8 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.32 
 
 		 575 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  29.01 
 
 		 487 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  24.62 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  18.34 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.26 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  28.49 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.29 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.77 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  29.18 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  27.57 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  22.98 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  35.59 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  26.4 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  39.73 
 
 		 195 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  27.11 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  18.28 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  26.02 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.51 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  18.53 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  26.91 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.86 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.73 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  33.14 
 
 		 555 aa  57  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  16.6 
 
 		 542 aa  57  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  24.29 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  17.2 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  24.31 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  27.48 
 
 		 673 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  29.14 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  25.34 
 
 		 634 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.75 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  32.99 
 
 		 168 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  38.67 
 
 		 498 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  41.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 162 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.93 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  36 
 
 		 163 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  23.08 
 
 		 766 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  33.91 
 
 		 165 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  30.69 
 
 		 190 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  24.2 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  26.89 
 
 		 153 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  40.26 
 
 		 491 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  25.97 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  27.82 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  24.32 
 
 		 169 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>