81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2252 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 634 aa  1222    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  39.18 
 
 		 504 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  36.7 
 
 		 527 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  37.33 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  38.47 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  38.69 
 
 		 550 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  32.95 
 
 		 609 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  31.18 
 
 		 554 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  32.72 
 
 		 540 aa  177  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  28.89 
 
 		 554 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 491 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  28.99 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.02 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  28.67 
 
 		 507 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  31.88 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  31.64 
 
 		 488 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  26.18 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  31.68 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  29.34 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  30.55 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 		 486 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  59.34 
 
 		 658 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  28.84 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  29.16 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  23.9 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  24.66 
 
 		 632 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.01 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  27.3 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  25.56 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.37 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  20.93 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  39.25 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.85 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  22.96 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.72 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  31.25 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.47 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  43.62 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  20.05 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.56 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.84 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  19.24 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.85 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.42 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.86 
 
 		 579 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.13 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.26 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.27 
 
 		 486 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.53 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  23.72 
 
 		 646 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.51 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  19.69 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  19.69 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.5 
 
 		 513 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  25.57 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  29.72 
 
 		 587 aa  54.3  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.05 
 
 		 492 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.49 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.08 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.12 
 
 		 512 aa  52  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 700 aa  51.6  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  23.63 
 
 		 549 aa  51.6  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.45 
 
 		 522 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  17.61 
 
 		 476 aa  50.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 		 555 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  24.14 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 521 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  22.48 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  33.85 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  22.19 
 
 		 551 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  36.63 
 
 		 165 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  19.2 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  26.98 
 
 		 766 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  22.46 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  28.79 
 
 		 170 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  27.74 
 
 		 483 aa  43.9  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  28.41 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.45 
 
 		 530 aa  43.9  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>