149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2979 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
555 aa  1070    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  52.37 
 
 
530 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  51.05 
 
 
555 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  44.85 
 
 
575 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  45.51 
 
 
491 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  43.05 
 
 
558 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  39.46 
 
 
521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  39.29 
 
 
551 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  35.21 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  32.81 
 
 
443 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  31.42 
 
 
469 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  31.54 
 
 
587 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  31.59 
 
 
476 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  31.95 
 
 
489 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  29.44 
 
 
449 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  36.42 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  34.08 
 
 
766 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  28.6 
 
 
539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  36.96 
 
 
467 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.2 
 
 
632 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.44 
 
 
486 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  32.08 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  27.89 
 
 
609 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 
646 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.38 
 
 
522 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  34.18 
 
 
167 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.19 
 
 
547 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
579 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  36.94 
 
 
554 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.86 
 
 
494 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.23 
 
 
480 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.88 
 
 
472 aa  61.6  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  40.38 
 
 
504 aa  61.6  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.4 
 
 
549 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.21 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.1 
 
 
493 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.29 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  42.5 
 
 
174 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  33.14 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  19.73 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  19.66 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 
179 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 
179 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 
179 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 
161 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.66 
 
 
479 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  27.94 
 
 
179 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  19.83 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  38.75 
 
 
165 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.33 
 
 
486 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  42.5 
 
 
183 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.05 
 
 
190 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  19.83 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  43.84 
 
 
171 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  39.02 
 
 
167 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.77 
 
 
514 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.85 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  19.43 
 
 
471 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.64 
 
 
172 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  40.51 
 
 
182 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  19.57 
 
 
474 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  19.25 
 
 
474 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  36.67 
 
 
165 aa  54.3  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 
190 aa  54.3  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  28.84 
 
 
544 aa  54.3  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  31.41 
 
 
658 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  35.78 
 
 
193 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  19.96 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  19.96 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  35.48 
 
 
170 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.31 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  26.97 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  19.76 
 
 
486 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  39.24 
 
 
182 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 
634 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 
511 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.76 
 
 
504 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  33.71 
 
 
174 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.58 
 
 
180 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  38.71 
 
 
168 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  31.18 
 
 
180 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.77 
 
 
471 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.12 
 
 
453 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  39.24 
 
 
155 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  19.7 
 
 
470 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  40.37 
 
 
519 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  35.4 
 
 
186 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  35.05 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  36.47 
 
 
189 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  34.31 
 
 
161 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  34.17 
 
 
540 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  38 
 
 
498 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  33.03 
 
 
165 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
176 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  31.97 
 
 
170 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  25.13 
 
 
532 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
467 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
491 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  26.67 
 
 
673 aa  47.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>