68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3849 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  85.56 
 
 		 180 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  85 
 
 		 180 aa  309  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  83.89 
 
 		 180 aa  307  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  78.77 
 
 		 179 aa  283  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  78.21 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  77.65 
 
 		 179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  79.1 
 
 		 176 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  76.54 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  64.41 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  58.05 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  57.31 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  33.14 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  34.09 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.5 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  32.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.21 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  32.73 
 
 		 513 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  29.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  32.14 
 
 		 514 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  25.17 
 
 		 555 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  29.47 
 
 		 522 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.89 
 
 		 549 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.27 
 
 		 504 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  26.06 
 
 		 579 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  23.53 
 
 		 486 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  26.77 
 
 		 489 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  39.34 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  39.34 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  37.8 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  31.71 
 
 		 501 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  30.91 
 
 		 501 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 		 575 aa  44.7  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  28.92 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  31.63 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  32.26 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.95 
 
 		 609 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  31.31 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  30.85 
 
 		 492 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  33.77 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  35.29 
 
 		 512 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 		 547 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.11 
 
 		 291 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  29.49 
 
 		 555 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 507 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 658 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 170 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  24.39 
 
 		 476 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.99 
 
 		 551 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 480 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 498 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.51 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  32.98 
 
 		 494 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  27.64 
 
 		 491 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  27.07 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 		 646 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  36.84 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.26 
 
 		 530 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>