63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3185 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  98.33 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  98.33 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  77.78 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  77.78 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  77.22 
 
 		 179 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  85.56 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  76.11 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  76.84 
 
 		 176 aa  277  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  64.41 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  58.89 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  60.82 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  33.71 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  32.58 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 		 513 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  29.84 
 
 		 522 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.52 
 
 		 549 aa  51.2  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  26.05 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 575 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.1 
 
 		 579 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  26 
 
 		 555 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  36.76 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.91 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  36.76 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.71 
 
 		 504 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  26.76 
 
 		 609 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  30.77 
 
 		 492 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  32.69 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  30.21 
 
 		 245 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  25.51 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 501 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.57 
 
 		 512 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.49 
 
 		 501 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  31.63 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  29.66 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 547 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.54 
 
 		 551 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 575 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.97 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  26.28 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  32.84 
 
 		 550 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 658 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  29.91 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  37.5 
 
 		 530 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  34.85 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  27.72 
 
 		 486 aa  40.8  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>