102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0158 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
551 aa  1083    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  73.39 
 
 
521 aa  742    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  47.38 
 
 
530 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  42.28 
 
 
575 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  40.76 
 
 
491 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 
555 aa  317  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 
555 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  38.4 
 
 
561 aa  294  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  35.05 
 
 
443 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  33.55 
 
 
469 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  45.31 
 
 
558 aa  202  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  33.49 
 
 
766 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  34.05 
 
 
489 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  34.19 
 
 
483 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  31.93 
 
 
476 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  29.38 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  38.71 
 
 
539 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  28.6 
 
 
467 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.49 
 
 
549 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  26.9 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.61 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  27.47 
 
 
587 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  27.27 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.15 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  27.22 
 
 
486 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23 
 
 
632 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  26.58 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.87 
 
 
554 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  25.87 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  25.4 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  28.52 
 
 
540 aa  70.1  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  26.91 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  21.86 
 
 
547 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  24.92 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  25.08 
 
 
474 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.49 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.93 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  26.21 
 
 
472 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  27.68 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  24.35 
 
 
476 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.99 
 
 
472 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.07 
 
 
575 aa  63.9  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  25.61 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  25.61 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  27.2 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  25.82 
 
 
550 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  20.72 
 
 
493 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  21.75 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  26.34 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  27.57 
 
 
453 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.71 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  27.45 
 
 
542 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  22.18 
 
 
472 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  28.46 
 
 
519 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  25.75 
 
 
516 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  28.88 
 
 
609 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  21.82 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  25.53 
 
 
515 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  23.13 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  32.32 
 
 
507 aa  54.7  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  23.62 
 
 
501 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  38.81 
 
 
643 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  27.52 
 
 
491 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 
165 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.93 
 
 
167 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  21.22 
 
 
527 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  21.22 
 
 
527 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  28.72 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  26.29 
 
 
480 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  24.47 
 
 
646 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  37.88 
 
 
498 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  22.11 
 
 
634 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.5 
 
 
513 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  46.43 
 
 
174 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  39.74 
 
 
165 aa  50.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  39.29 
 
 
161 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  33.64 
 
 
611 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  24.69 
 
 
514 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  44.64 
 
 
183 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  28.09 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  41.27 
 
 
182 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 
488 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  24.62 
 
 
522 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  57.78 
 
 
171 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 
532 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.29 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  36.78 
 
 
167 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 
193 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 
182 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  36.92 
 
 
159 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  25.46 
 
 
511 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.17 
 
 
177 aa  44.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.86 
 
 
504 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  41.54 
 
 
174 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  23.23 
 
 
673 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.29 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.51 
 
 
192 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  25.3 
 
 
114 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  28.99 
 
 
179 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>