64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1761 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  97.67 
 
 
472 aa  892    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  929    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.8 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.03 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  19.96 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.53 
 
 
486 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.5 
 
 
474 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.86 
 
 
479 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.8 
 
 
480 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  22.89 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.52 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.56 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.5 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.17 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.01 
 
 
472 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.17 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.31 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  22.72 
 
 
501 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.17 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.17 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  19.82 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  21.87 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  19.6 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.3 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.51 
 
 
504 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.32 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.28 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  21.51 
 
 
632 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  22.91 
 
 
551 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  17.83 
 
 
515 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  18.15 
 
 
480 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  22.93 
 
 
554 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  24 
 
 
495 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  20.77 
 
 
561 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  20.96 
 
 
498 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  23.05 
 
 
541 aa  53.9  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  18.43 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  19.73 
 
 
575 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  19.18 
 
 
483 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  21.98 
 
 
449 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  19.71 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  19.88 
 
 
549 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  23.12 
 
 
506 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  18.87 
 
 
504 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  21.56 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.9 
 
 
514 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  16.95 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  20.15 
 
 
521 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  16.95 
 
 
474 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  19.45 
 
 
513 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 
527 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 
527 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  18.33 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  23.21 
 
 
643 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  19.4 
 
 
489 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  16.95 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.12 
 
 
547 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  19.45 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  21.52 
 
 
619 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  19.1 
 
 
673 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  18.93 
 
 
504 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  16.83 
 
 
493 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 
646 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 
579 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>