61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3047 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 504 aa  1032    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  31.41 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.89 
 
 		 513 aa  169  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  25.14 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  24.61 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.92 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.76 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  22.59 
 
 		 514 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  24.02 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.6 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  23.52 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.49 
 
 		 501 aa  93.6  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  22.04 
 
 		 632 aa  93.2  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.96 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  24.62 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  22.88 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  23.91 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.5 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.64 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.45 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  19.73 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.62 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.91 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  18.97 
 
 		 474 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.08 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.5 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  21.95 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.27 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  19.59 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  22.04 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.05 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  23.1 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  20.63 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.67 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.09 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  19.59 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.09 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.3 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.72 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  22.25 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.87 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  19.77 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.72 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  19.9 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  21.5 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  20.55 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  20.39 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  24.68 
 
 		 171 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.13 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  19.24 
 
 		 643 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  21.32 
 
 		 506 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  20.42 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  29.91 
 
 		 169 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  22.88 
 
 		 619 aa  47.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.34 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.67 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  26.12 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  18.93 
 
 		 609 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  25.17 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 700 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 561 aa  43.9  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>