110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0853 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1171    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  42.1 
 
 
516 aa  314  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  42.03 
 
 
491 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  42.35 
 
 
501 aa  296  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  39.96 
 
 
527 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  39.81 
 
 
483 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  35.35 
 
 
507 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  38.53 
 
 
480 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  35.99 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  35.87 
 
 
554 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  35.25 
 
 
511 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  36.87 
 
 
486 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  36.5 
 
 
486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  36.14 
 
 
474 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  34.42 
 
 
540 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  36.56 
 
 
550 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  39.11 
 
 
504 aa  204  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  36 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  34.01 
 
 
611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
634 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  32.47 
 
 
488 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35.1 
 
 
508 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  35.77 
 
 
643 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  34.28 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  29.89 
 
 
532 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  35.51 
 
 
658 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.66 
 
 
471 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.2 
 
 
632 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.01 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.91 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22.63 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.76 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.21 
 
 
472 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  23.08 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25.38 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.69 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.91 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  18.98 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.29 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.92 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  18.46 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  18.8 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  18.65 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.34 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.28 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  18.65 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.54 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  18.46 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  18.46 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.54 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 
489 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.4 
 
 
476 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.47 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.03 
 
 
493 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.97 
 
 
522 aa  64.3  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.5 
 
 
491 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  25.54 
 
 
561 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  35.2 
 
 
575 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.26 
 
 
513 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.07 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  32.5 
 
 
161 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  27.5 
 
 
673 aa  59.7  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  35.94 
 
 
558 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  37.88 
 
 
443 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.68 
 
 
542 aa  58.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  35.88 
 
 
469 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  32.69 
 
 
521 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.35 
 
 
494 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30.49 
 
 
575 aa  57.4  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  23.93 
 
 
377 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 
193 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  29.94 
 
 
167 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.86 
 
 
506 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  33.83 
 
 
555 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  32.52 
 
 
165 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.73 
 
 
551 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.4 
 
 
541 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  20.77 
 
 
504 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.77 
 
 
514 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  23.12 
 
 
501 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 
619 aa  51.2  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  37.78 
 
 
174 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.71 
 
 
512 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  29.45 
 
 
171 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  39.19 
 
 
171 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 
498 aa  48.5  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  30.34 
 
 
174 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.26 
 
 
449 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  21.6 
 
 
515 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  35.44 
 
 
183 aa  47.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  33.66 
 
 
587 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  29.35 
 
 
152 aa  47.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
165 aa  47.4  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.85 
 
 
579 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  31.4 
 
 
164 aa  47.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  27.46 
 
 
180 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.7 
 
 
195 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  28.85 
 
 
530 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  19.73 
 
 
504 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  32.22 
 
 
177 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>