120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4496 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
171 aa  332  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  51.43 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  46.55 
 
 
170 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  69.66 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  50 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  45.56 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  48.12 
 
 
148 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  45.45 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  58.93 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  48.88 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  46.71 
 
 
165 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  47.5 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  48.41 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  52.59 
 
 
161 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  57.3 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  42.24 
 
 
167 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  38.71 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  42.06 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.95 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  31.67 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  37.8 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  33.94 
 
 
486 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  30.16 
 
 
186 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  39.77 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  37.84 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.18 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  32.24 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  34.31 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  36.08 
 
 
646 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  36.05 
 
 
547 aa  54.3  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  35.23 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  35.23 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  31.91 
 
 
480 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  31.01 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  35.23 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  35.23 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  24.68 
 
 
504 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  31.01 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.44 
 
 
632 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.88 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.95 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  36.59 
 
 
700 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  33.57 
 
 
494 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  28.06 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  30.92 
 
 
491 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  38.36 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  26.36 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  29.45 
 
 
609 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 
619 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  37.62 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 
449 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  31.91 
 
 
483 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  27.13 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 
558 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  36.79 
 
 
549 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  37.68 
 
 
579 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  33.66 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  37.66 
 
 
491 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  32.43 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  37.21 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  33.96 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  32.67 
 
 
527 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  29.79 
 
 
487 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
493 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 
476 aa  47.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  34.52 
 
 
181 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  30.61 
 
 
184 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  35.96 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  24.52 
 
 
242 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  30.15 
 
 
516 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  34.07 
 
 
673 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.84 
 
 
163 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  26.8 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  44.83 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  29.06 
 
 
550 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 
486 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 
216 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  27.91 
 
 
540 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.43 
 
 
575 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 
486 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  37.5 
 
 
766 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  27.93 
 
 
207 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 
467 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  19.5 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.77 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  33.75 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>