81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01634 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  32.54 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  29.48 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  35.04 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  43.42 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  36.63 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  38.96 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  34.91 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  40.26 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  38.82 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  33.94 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.77 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.02 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  32.26 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  41.89 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  37.65 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  43.75 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  38.89 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  46.27 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  36.47 
 
 		 158 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  41.89 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  38.96 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  34.29 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  40.54 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  37.7 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  28.75 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  38.36 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  37.66 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  32.08 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.17 
 
 		 549 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  43.06 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  32.04 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  34.83 
 
 		 575 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  36.99 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  28.81 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.11 
 
 		 632 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  30.67 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  37.33 
 
 		 512 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  28.16 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  27.85 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  31.96 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  27.88 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.87 
 
 		 575 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  31.52 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0731  hypothetical protein  26.47 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26.47 
 
 		 169 aa  42  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 163 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 163 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 		 493 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.58 
 
 		 504 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>