112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2982 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
183 aa  349  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  49.33 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  45.07 
 
 
167 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  42.38 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  41.21 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 
165 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  38.71 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  42.77 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  42.11 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  55.42 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  37.16 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  44.44 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  41.55 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  53.01 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  43.75 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  44.23 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  38.92 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  48.1 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  48.72 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  44.44 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  35.33 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.46 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  26.39 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  32.59 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  36.54 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  31.08 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  26.06 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  39.77 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  25.69 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  24.66 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  41.25 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  38.27 
 
 
228 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  43.75 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  34.59 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  38.66 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  35.58 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  35.63 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  35.21 
 
 
165 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  24.43 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  35.92 
 
 
165 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  42.42 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  24.43 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  34.12 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.33 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  24.43 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  21.83 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  24.43 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  32.04 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  20.37 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  32.12 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.1 
 
 
673 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  48.08 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  43.08 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  36.73 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.06 
 
 
619 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  25.56 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.91 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  35.71 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  32.39 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  32.39 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  28.75 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  32.04 
 
 
547 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  30.93 
 
 
533 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.73 
 
 
579 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  40.28 
 
 
153 aa  44.7  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  32.1 
 
 
449 aa  44.3  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.34 
 
 
512 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.1 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  31.46 
 
 
486 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  34.51 
 
 
549 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  34.06 
 
 
555 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  31.18 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.13 
 
 
646 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  29.31 
 
 
487 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  48.84 
 
 
489 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  26.23 
 
 
493 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  20.72 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  36.78 
 
 
554 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  38.24 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 
153 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  32.32 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  50 
 
 
476 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>