104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3581 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  44.03 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  47.5 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  49.01 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  45.73 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  48.43 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  44.17 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  44.17 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  44.17 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  44.94 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  41.62 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  47.8 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  44.65 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  43.04 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  44.72 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  43.67 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  41.1 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  43.48 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.15 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  35.06 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  51.04 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  49.47 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  43.4 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  35.29 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  36.81 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  39.61 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  34.39 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  37.01 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  34.67 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.97 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.57 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  33.12 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  34.33 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  32.24 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  36.29 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  40.51 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  25.95 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  28.16 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.9 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  30.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  31.76 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  30.11 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  30.11 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  29.75 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  33.73 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  25.5 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  36.84 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  25.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  38.82 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.61 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  24.14 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  25.24 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  24.48 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  24.48 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  35.56 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  29.75 
 
 		 487 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  29.27 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  35.43 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  35.48 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  35 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  34.48 
 
 		 491 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  33.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  32.56 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  30.08 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 		 242 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  31.03 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  28.36 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  37.35 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  31.15 
 
 		 550 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0731  hypothetical protein  20.65 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 		 507 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  27.88 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.12 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  31.31 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25.87 
 
 		 673 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  27.63 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  36.49 
 
 		 549 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  36.51 
 
 		 646 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  24.04 
 
 		 472 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.8 
 
 		 512 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>