116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6785 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  326  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  57.49 
 
 
172 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  53.89 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  50.9 
 
 
193 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  41.07 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  43.6 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  42.26 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 
181 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  41.32 
 
 
159 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  39.52 
 
 
165 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  37.13 
 
 
166 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  49.5 
 
 
168 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  38.82 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  47.71 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  44.95 
 
 
174 aa  97.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  47.96 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  40 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  48.42 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
160 aa  89  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  45.36 
 
 
177 aa  87.4  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  46.32 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  44.33 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  44.33 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  44.33 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  46.43 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.39 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  25.77 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  29.88 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  41.89 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  25.2 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  40.7 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  33.93 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  38.75 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.5 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  44.78 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  40.54 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  38.37 
 
 
161 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  28.05 
 
 
163 aa  52  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  37.74 
 
 
174 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  44.12 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  33.02 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  35.9 
 
 
550 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  35.14 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  38.36 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  31.82 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  38.95 
 
 
486 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  36.96 
 
 
579 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  41.18 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  27.59 
 
 
486 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  34.62 
 
 
673 aa  47.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.36 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 
555 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  27.59 
 
 
474 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  23.53 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  28.43 
 
 
467 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  27.59 
 
 
474 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  37.68 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 
549 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  34.62 
 
 
658 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  37.93 
 
 
498 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  40.98 
 
 
507 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 
632 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.95 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  27.1 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.95 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.95 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 
646 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  34.88 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  40.45 
 
 
609 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  38.04 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.16 
 
 
203 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  36.36 
 
 
554 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.44 
 
 
512 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  25.22 
 
 
470 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  34.15 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  28.81 
 
 
480 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 
489 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  27.21 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  31.52 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  26.24 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  30.48 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 
547 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  20.91 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  24.12 
 
 
158 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  24.12 
 
 
158 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  24.12 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  24.12 
 
 
158 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  24.24 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  26.67 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 
483 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  26.87 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  28.41 
 
 
611 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>