78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11250 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  939    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  67.57 
 
 
486 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  67.36 
 
 
486 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  67.3 
 
 
474 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  64.86 
 
 
480 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  62.03 
 
 
483 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  38.02 
 
 
609 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  39.87 
 
 
491 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  40.73 
 
 
516 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  37.6 
 
 
501 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  34.52 
 
 
527 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  33.89 
 
 
511 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  34.26 
 
 
507 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  34.66 
 
 
554 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  35.4 
 
 
504 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  34.06 
 
 
519 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  31.73 
 
 
540 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  35.64 
 
 
488 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  38 
 
 
550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  29.44 
 
 
611 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  32.06 
 
 
532 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  32.01 
 
 
634 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.51 
 
 
508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  28.76 
 
 
554 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  39.26 
 
 
658 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  32.18 
 
 
643 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.84 
 
 
476 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.68 
 
 
504 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.95 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.09 
 
 
480 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.89 
 
 
486 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  28.15 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.53 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.37 
 
 
470 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19 
 
 
479 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  28.66 
 
 
501 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  44.44 
 
 
587 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.06 
 
 
480 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  19.16 
 
 
474 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.83 
 
 
486 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.51 
 
 
549 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  25.96 
 
 
561 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  30.64 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  24.65 
 
 
515 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  27.3 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  19.33 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  21.48 
 
 
514 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.22 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  28.53 
 
 
530 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  26.12 
 
 
646 aa  53.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  21.05 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  33.98 
 
 
193 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  14.68 
 
 
542 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  23.6 
 
 
486 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  25.62 
 
 
766 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 
495 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  26.71 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  29.75 
 
 
166 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  25.42 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  22.22 
 
 
114 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  31.16 
 
 
171 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.36 
 
 
551 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.62 
 
 
521 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  24.74 
 
 
165 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.41 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  27.56 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.32 
 
 
494 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  22.38 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.97 
 
 
152 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.66 
 
 
167 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  24.92 
 
 
539 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  27.08 
 
 
575 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
476 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 
449 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  35.38 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.2 
 
 
579 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>