93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  100 
 
 		 587 aa  1136    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.29 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  29.13 
 
 		 555 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  26.07 
 
 		 558 aa  146  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.76 
 
 		 575 aa  137  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 		 476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.61 
 
 		 530 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  31.08 
 
 		 491 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  26.27 
 
 		 489 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  33.11 
 
 		 551 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 521 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  33.81 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.08 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  32.79 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  33.93 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  27.67 
 
 		 609 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  42.39 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  25.21 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  35.62 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  26.3 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.77 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  26.32 
 
 		 511 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  31.11 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 472 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  31.11 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  31.4 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  37.14 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  31.11 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  27.27 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  31.17 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  26.45 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  27.27 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  30.88 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  30.88 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  32.35 
 
 		 470 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  31.39 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25.45 
 
 		 673 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  26.44 
 
 		 504 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.41 
 
 		 632 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  31.58 
 
 		 766 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  28.22 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  33.58 
 
 		 516 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 		 488 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  30.51 
 
 		 486 aa  54.3  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  28.99 
 
 		 114 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.07 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  36.29 
 
 		 540 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  23.15 
 
 		 542 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 		 495 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.21 
 
 		 619 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  34.82 
 
 		 501 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  24.24 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  34.52 
 
 		 554 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 		 152 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 579 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.17 
 
 		 522 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  28 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  26.32 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.41 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  33.77 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  34.78 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  26.37 
 
 		 467 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  27.75 
 
 		 203 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.71 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  31.87 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  48.5  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  33.93 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.79 
 
 		 177 aa  47.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  34.72 
 
 		 646 aa  47.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  33.64 
 
 		 486 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  33.64 
 
 		 474 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  21.51 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  31.97 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  21.43 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  27.22 
 
 		 228 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  25.88 
 
 		 527 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  26.39 
 
 		 242 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  35.9 
 
 		 164 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 507 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>