64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0623 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  36.11 
 
 
561 aa  58.2  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  29.81 
 
 
609 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  28.77 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.75 
 
 
177 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  33.98 
 
 
487 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  24.32 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.53 
 
 
646 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  30.28 
 
 
632 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  28.57 
 
 
472 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  35.53 
 
 
579 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  36.62 
 
 
550 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  30.47 
 
 
611 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32.52 
 
 
195 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  40 
 
 
486 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  27.47 
 
 
480 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  37.8 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  33.87 
 
 
558 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  26.21 
 
 
472 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 
472 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  27.47 
 
 
479 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  28.77 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  30.21 
 
 
472 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  27.86 
 
 
472 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  27.86 
 
 
547 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  27.86 
 
 
472 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  26.98 
 
 
472 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  28.74 
 
 
700 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.81 
 
 
530 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  29.35 
 
 
575 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  32.61 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  29.7 
 
 
155 aa  44.7  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  25.19 
 
 
472 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  40.3 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 
555 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 
575 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  27.42 
 
 
483 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  38.16 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  38.16 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  32.95 
 
 
501 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 
555 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  35.8 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  26.37 
 
 
470 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.69 
 
 
512 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  26.37 
 
 
486 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  34.18 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  26.37 
 
 
471 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  27.16 
 
 
471 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  27.16 
 
 
453 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  26.23 
 
 
480 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  28.97 
 
 
174 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  32.54 
 
 
533 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  28.44 
 
 
242 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  26 
 
 
511 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  31.67 
 
 
474 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>