79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3512 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 491 aa  917    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  41.85 
 
 		 609 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  41.42 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  40 
 
 		 487 aa  259  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  37.87 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  38.68 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  37.87 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  37.76 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  36.61 
 
 		 527 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  33.66 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  37.37 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  35.46 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  37.25 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  34.39 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  31.51 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  36.9 
 
 		 550 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  33.01 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  33.81 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  33.11 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  35.27 
 
 		 488 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  32.82 
 
 		 643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  34.34 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  40.93 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.83 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.2 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.25 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  27.19 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.29 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.69 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.15 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.67 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.39 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  31.05 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.37 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.7 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.05 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.3 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.74 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.35 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.15 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.39 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.65 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  27.98 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.24 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  30.63 
 
 		 498 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.94 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.91 
 
 		 542 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  19.31 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  19.31 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  29.73 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  29.29 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.91 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.4 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  19.86 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.33 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.69 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  35.42 
 
 		 195 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.81 
 
 		 575 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  30.92 
 
 		 171 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.95 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.84 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  34 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 186 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 555 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.77 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  31.5 
 
 		 153 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  26.13 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  31.41 
 
 		 165 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  27.17 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  24.6 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  29.19 
 
 		 170 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.57 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>