114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2893 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 643 aa  1243    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  49.07 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  44.47 
 
 		 508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  44.01 
 
 		 532 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  38 
 
 		 488 aa  211  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  32.19 
 
 		 609 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  31.43 
 
 		 554 aa  183  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  32.65 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  34.35 
 
 		 491 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  31.29 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  31.5 
 
 		 634 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  32.6 
 
 		 507 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  32.21 
 
 		 519 aa  147  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  30.98 
 
 		 511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  31.87 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  31.7 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  31.98 
 
 		 483 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  30.66 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 		 540 aa  127  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  29.9 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  28.19 
 
 		 611 aa  124  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  29.56 
 
 		 474 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  23.23 
 
 		 486 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.04 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.89 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.98 
 
 		 474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.92 
 
 		 474 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.81 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.97 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  28.35 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.51 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.84 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.74 
 
 		 470 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  25.66 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  33.76 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.25 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  35.55 
 
 		 658 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  31.91 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.29 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  31.44 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.31 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.86 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  26.68 
 
 		 579 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  21.53 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.52 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  30.23 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.11 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.79 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  22.76 
 
 		 467 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.24 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  31.88 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  20.61 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  27.91 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  20.67 
 
 		 542 aa  67  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.71 
 
 		 646 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  19.41 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  32.12 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  19.54 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  30.64 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  18.28 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  19.54 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.02 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  29.79 
 
 		 193 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.91 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  25.43 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  28.87 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.93 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.5 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  31.62 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.49 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.59 
 
 		 472 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  38.37 
 
 		 555 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  22.45 
 
 		 575 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  38.24 
 
 		 766 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.21 
 
 		 549 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.11 
 
 		 530 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  39.56 
 
 		 443 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.41 
 
 		 472 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  32.31 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.17 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  26.8 
 
 		 673 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.62 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 170 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  30.65 
 
 		 203 aa  51.6  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  28.97 
 
 		 114 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.5 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.5 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32.26 
 
 		 180 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.27 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  19.2 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  28.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.58 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.73 
 
 		 166 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  27.03 
 
 		 2179 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  31.86 
 
 		 587 aa  47.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>