94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3754 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  99.44 
 
 
179 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  98.32 
 
 
179 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  97.21 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  86.44 
 
 
176 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  78.33 
 
 
180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  77.22 
 
 
180 aa  283  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  77.78 
 
 
180 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  78.77 
 
 
180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  59.43 
 
 
176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  64.77 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  64.12 
 
 
178 aa  197  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  34.68 
 
 
183 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.01 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  31.43 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.94 
 
 
555 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.82 
 
 
514 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.46 
 
 
549 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
513 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  27.01 
 
 
522 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.69 
 
 
480 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.4 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.09 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  26.8 
 
 
189 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  36.26 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 
504 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  26.5 
 
 
493 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.97 
 
 
579 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  32.32 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 
533 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.82 
 
 
530 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  29.52 
 
 
168 aa  44.3  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 
203 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  33.71 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.81 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  37.7 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.99 
 
 
551 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 
632 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  40.74 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  39.68 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  27.72 
 
 
575 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  37.29 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  37.04 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  35.29 
 
 
512 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  26.72 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  32.81 
 
 
498 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  32.05 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  29.58 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  40.43 
 
 
547 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.74 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  32.47 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.49 
 
 
501 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
165 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
165 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  31.15 
 
 
160 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
165 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  30.99 
 
 
155 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  26.32 
 
 
182 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  28.8 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29.17 
 
 
283 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  27.59 
 
 
443 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  29.63 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.18 
 
 
489 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.51 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.69 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  32.79 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  33.82 
 
 
180 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  30.43 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  36.07 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  26.28 
 
 
609 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  32.86 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  31.63 
 
 
291 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  29.76 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 
171 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>