87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0679 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  98.88 
 
 
179 aa  359  9e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  97.77 
 
 
179 aa  356  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  97.21 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  85.31 
 
 
176 aa  298  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  76.67 
 
 
180 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  75.56 
 
 
180 aa  278  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  76.11 
 
 
180 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  76.54 
 
 
180 aa  247  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  58.29 
 
 
176 aa  214  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  63.64 
 
 
179 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  63.53 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  34.1 
 
 
183 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  31.43 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.94 
 
 
555 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  34.34 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 
514 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.46 
 
 
549 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 
522 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
513 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  28.46 
 
 
480 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.91 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.12 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 
504 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.97 
 
 
579 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 
189 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  28.21 
 
 
493 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  35.16 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 
533 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  31.31 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.81 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  42.55 
 
 
547 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  29.52 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 
632 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.41 
 
 
530 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 
255 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  28.85 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  38.89 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  37.5 
 
 
512 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  33.71 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  36.07 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.74 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  33.77 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  36.71 
 
 
501 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  39.22 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  37.04 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.54 
 
 
551 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.73 
 
 
575 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 
153 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.18 
 
 
489 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 
658 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  34.85 
 
 
550 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  30.21 
 
 
207 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  31.18 
 
 
498 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  25.42 
 
 
443 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  33.82 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  31.15 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.69 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  30.99 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.51 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  29.17 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  29.17 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  31.96 
 
 
492 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  29.17 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>