66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0020 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  83.43 
 
 		 169 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  74.12 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  70.41 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  60.82 
 
 		 176 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  41.88 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  46.1 
 
 		 371 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  42.95 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  43.59 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  46.2 
 
 		 282 aa  131  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  49.35 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  41.61 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  40.25 
 
 		 255 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  42.68 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  41.61 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  41.67 
 
 		 291 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  38.06 
 
 		 252 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  39.38 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  35.67 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  33.54 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  32.92 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  32.59 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  32.59 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  30.72 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  32.59 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  28.28 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  33.67 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.14 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 479 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  31.43 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.76 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.03 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  25.83 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  28.26 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  26.88 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  32.14 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  38.98 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  24.48 
 
 		 574 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.27 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25.62 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  27.16 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 		 504 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  25.84 
 
 		 522 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 514 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  31.4 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  31.4 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  27.61 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  31.4 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.01 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  31.4 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  22.22 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  30.11 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  22.76 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  29.07 
 
 		 180 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  25.58 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  25.58 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  24.37 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>