80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0154 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
178 aa  355  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  49.16 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  41.14 
 
 
181 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  38.15 
 
 
189 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  37.1 
 
 
189 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  33.14 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  38.12 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  34.16 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  35.03 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  35.03 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
180 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  35.03 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.77 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  40 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.73 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  35.43 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  34.64 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  31.64 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.93 
 
 
479 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  30.22 
 
 
209 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  29.8 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.1 
 
 
252 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  33.62 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  25.95 
 
 
282 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  23.6 
 
 
227 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  29.01 
 
 
247 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.99 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  28.85 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  27.01 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  20.75 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  34.09 
 
 
658 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  24.52 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  27.81 
 
 
179 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  30.21 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  30.21 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  23.08 
 
 
170 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  30.53 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  33.09 
 
 
609 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 
522 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  25.85 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  27.35 
 
 
501 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  28.75 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  27.48 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.17 
 
 
219 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  27.96 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  31.86 
 
 
530 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  24.1 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  21.37 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  25.58 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 
575 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  30 
 
 
487 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  24.63 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.5 
 
 
514 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.41 
 
 
504 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  38.57 
 
 
575 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.56 
 
 
512 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.08 
 
 
549 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  34.12 
 
 
634 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
513 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 
558 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  23.81 
 
 
229 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  28.91 
 
 
508 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.07 
 
 
291 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  28.81 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.4 
 
 
232 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  20.65 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  28.36 
 
 
198 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  41.07 
 
 
126 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>