48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1403 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  77.78 
 
 		 172 aa  261  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  55.15 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  46.91 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  39.74 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  39.38 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  37.27 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32.72 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32.72 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  36.54 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  34.97 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  37.58 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  29.86 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  29.86 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  30.61 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  27.45 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.93 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.74 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.26 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  29.41 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.52 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  27.04 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  27.04 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  27.04 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25.68 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  26.28 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.97 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  28.18 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25.44 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  30.72 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  23.13 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  24.63 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  24.81 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  25.66 
 
 		 245 aa  44.3  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  24.81 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  36.36 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.21 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  26.71 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  24.26 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  24.63 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.21 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  24.44 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  23.53 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  35.9 
 
 		 232 aa  40.8  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>