70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1313 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  99.42 
 
 
172 aa  342  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  79.65 
 
 
181 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  78.49 
 
 
172 aa  270  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  71.51 
 
 
172 aa  248  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  56.14 
 
 
185 aa  205  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  50.29 
 
 
170 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  45.73 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  48.7 
 
 
182 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  41.88 
 
 
181 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  42.59 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  39.87 
 
 
180 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  36.25 
 
 
189 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  33.53 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  36.25 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  33.54 
 
 
479 aa  94  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  47.67 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  36.21 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  35.03 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  26.97 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  25.33 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
255 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.66 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.97 
 
 
247 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.16 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  26.54 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  27.12 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  38.46 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  25.99 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 
219 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.98 
 
 
229 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  25.77 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  24.67 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  29.81 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  41.67 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25.68 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25.68 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  27.07 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  29.45 
 
 
243 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  31.2 
 
 
232 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  34.85 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  34.85 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.04 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 
229 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  40 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  22.88 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  38.98 
 
 
245 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  25.71 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  27.11 
 
 
282 aa  48.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  27.97 
 
 
561 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.53 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  26.87 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  27.69 
 
 
371 aa  44.3  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  22.31 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  42.55 
 
 
658 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  26.26 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  29.87 
 
 
541 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  29.1 
 
 
511 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  32.84 
 
 
554 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>