55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1045 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 182 aa  352  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  48.17 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  48.17 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  48.17 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  43.37 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  45.73 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  44.51 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  43.29 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  40.12 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  34.36 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  38.92 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  36.26 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  35.93 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  34.68 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  38.01 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  35.5 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  38.82 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  32.77 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.13 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.44 
 
 		 479 aa  77.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  37.7 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  31.31 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.64 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25.58 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25.29 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  29.93 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29.93 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  33.14 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  29.25 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.42 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  30.39 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.29 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  29.24 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  33.09 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  29.82 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  29.63 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  26.53 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  29.38 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  26.95 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  31.34 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  25.74 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  23.91 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  26.17 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.06 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  28.98 
 
 		 243 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  25.5 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>