31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2927 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  32 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  36.17 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  33.64 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 555 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25.62 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1510 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  28.19 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  25.18 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  29.47 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  27.42 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.26 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.42 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  25.16 
 
 		 530 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  33.33 
 
 		 491 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  23.66 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  31.87 
 
 		 575 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  35.38 
 
 		 174 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 		 174 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.91 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 146 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  23.68 
 
 		 175 aa  42  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  27.82 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  23.68 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  23.16 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  25.34 
 
 		 469 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  24.74 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>