30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1762 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  303  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00888497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1491  membrane flanked domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  303  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  36.96 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  30.34 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  26.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  24.47 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  22.89 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 		 511 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  22.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  19.39 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  23.66 
 
 		 191 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  27.08 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  26.21 
 
 		 472 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  20.39 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  28.33 
 
 		 501 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  21.79 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 507 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  21.95 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  21.59 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>