101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0795 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  44.71 
 
 
181 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  42.69 
 
 
189 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  40.94 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  40.36 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  42.59 
 
 
172 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  42.59 
 
 
172 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  42.59 
 
 
172 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  40.36 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  46.3 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  39.39 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  40.44 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  41.71 
 
 
209 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  41.98 
 
 
181 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  39.88 
 
 
167 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  39.75 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  39.63 
 
 
172 aa  117  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  34.44 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  35.12 
 
 
166 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  37.97 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  35.93 
 
 
479 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  32.75 
 
 
166 aa  94.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  36.09 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  31.87 
 
 
178 aa  90.9  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  28.48 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  27.67 
 
 
232 aa  57.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.81 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  23.2 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.85 
 
 
227 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  27.15 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  35.21 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  35.21 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  37.1 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  35.21 
 
 
179 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 
179 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  26.09 
 
 
169 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  28.29 
 
 
283 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.21 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  31 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  22.56 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  24.3 
 
 
198 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.81 
 
 
291 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  33.8 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  33.8 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  23.31 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  28 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  27.59 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
575 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  24.55 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  28.09 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  21.97 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  30.59 
 
 
646 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  23.08 
 
 
512 aa  48.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  33.87 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  27.55 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  24.85 
 
 
513 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  24.54 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  30.16 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  25.9 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  34.44 
 
 
483 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  32.1 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
547 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25.48 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  29.01 
 
 
371 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.3 
 
 
579 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  21.82 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  37.84 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  37.84 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  37.84 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  25.6 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  25.6 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.26 
 
 
541 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  25.37 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  26.53 
 
 
493 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
550 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  32.31 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.69 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.69 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  29.81 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.41 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.89 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  27.08 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  28.41 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  25.58 
 
 
247 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  23.7 
 
 
243 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  28.7 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  23.64 
 
 
507 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.93 
 
 
514 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.23 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  29 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>