67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4362 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 209 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  47.27 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  41.72 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  41.71 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  44.24 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  38.04 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  39.75 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  33.74 
 
 		 166 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  34.01 
 
 		 479 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  44.12 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  37.27 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.72 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  33.52 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  34.59 
 
 		 180 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  41.01 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.54 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  30.22 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  39.62 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  31.69 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  29.38 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  30.72 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  34.44 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  27.89 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  31.95 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  26.8 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  32.62 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24.44 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.23 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.46 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.46 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  29.49 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.38 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.06 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  25.6 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  25.57 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.86 
 
 		 158 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  31.06 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  26.97 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  21.53 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  23.95 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  23.72 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  33.04 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  31.68 
 
 		 541 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 		 555 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  21.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  26.24 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  26.03 
 
 		 165 aa  45.1  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  31.18 
 
 		 634 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  30.52 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  32.81 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 		 575 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  33.86 
 
 		 646 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  27.52 
 
 		 575 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  31.48 
 
 		 521 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  28.97 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  21.85 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  22.83 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  29.31 
 
 		 480 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  26.58 
 
 		 506 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  28.95 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>