53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1149 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  30.66 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  34.67 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  33.11 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  34.42 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  28.93 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32.53 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  39.29 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.95 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.95 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  35.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  28.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  22.64 
 
 		 479 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  43.48 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.16 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  27.41 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  36.84 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  31.82 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  42.11 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.05 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  35.38 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  25.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  25.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  31.51 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  22.47 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.41 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  34 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.55 
 
 		 514 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  35.59 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  36.51 
 
 		 208 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  29.82 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.05 
 
 		 575 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  29.31 
 
 		 169 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>