132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0685 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  48.65 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
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NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
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NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  24.12 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.61 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  24.32 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  23.16 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.07 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  22.29 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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