More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0446 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 372 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  34.78 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  36.63 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.65 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  28.95 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.36 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  30.51 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  27.8 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  24.5 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  23.12 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  44.93 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  50 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  26.53 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
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NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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